生物学和医学

抽象的

使用 MTHFR 基因的同源模型结构预测癌症中的药物-靶标相互作用

Ch KK、Jamil K、Raju GS

药物基因组学使用生物信息学工具来研究个体的基因组成如何影响身体对药物的反应。我们的目标是了解乳腺癌药物代谢基因（如 MTHFR）的结构变异可能发挥的作用，这些基因与肿瘤药物（如环磷酰胺、5-氟尿嘧啶、甲氨蝶呤等）密切相关。我们研究了可能影响这些分子药物结合能力的基因多态性。我们使用 VEGA 基因组浏览器获取有关基因结构的信息，并使用 NCBI 的 dbSNP 获取 SNP。从 NCBI 数据库中检索蛋白质序列，并使用瑞士同源性方法构建蛋白质结构。使用基于 Linux 的软件 TRITON 研究和确定结构中的突变。为了预测化疗药物的药物结合能力的变化，我们使用了 Molegro Virtual Docker。这项研究表明，突变的 MTHFR 蛋白质结构的结合能大于野生型蛋白质的结合能。这表明导致结构改变的突变会调节药物与各种配体（药物）的结合能。因此，这表明蛋白质结构的变化会影响药物结合能力，也会影响与药物-基因相互作用相关的药物毒性。这是这些药物-基因相互作用的第一份计算报告。这项研究确定了常用于治疗乳腺癌的化疗药物中的药物-基因组相互作用。这可以作为药物设计或选择适合个体患者基因组反应的药物的模型研究。