基因组学和蛋白质组学数据挖掘杂志

抽象的

流浪蜘蛛（ Tegenaria agrestis）麻痹性杀虫毒素（ITX-1）的三维结构预测

AGIngale 和 NJChikhale

麻痹性杀虫毒素 (ITX-1) (Tegenaria agrestis) 涉及多种抗原成分，可指导和增强免疫系统以保护宿主免受感染。对受体具有纳摩尔亲和力的蜘蛛肽毒素是了解离子通道生理作用的有前途的药理学工具，并可作为开发离子通道相关疾病的新治疗剂和策略的线索。为 Tegenaria agrestis (Hobo spider) 的麻痹性杀虫毒素 (ITX-1) 开发了一个三维模型 (3D)。使用同源建模方法预测结构。对于建模，通过 mGenTHERADER 获得模板蛋白，即 Clostridium acidurici 的铁氧还蛋白 (1FCA) 的高分辨率 X 射线晶体学结构。通过比较模板蛋白，使用比较建模程序 MODELLER 为目标蛋白构建了一个粗略模型。使用蛋白质结构检查工具（例如 PROCHECK 和 WHAT IF）验证了该模型的可靠性。由此讨论的信息为麻痹性杀虫毒素 (Tegenaria agrestis) 的分子理解提供了见解。预测的 3-D 模型可进一步用于在湿实验室中表征蛋白质。