基因组学和蛋白质组学数据挖掘杂志

抽象的

针对 H5N1 和 H1N1 NS1 蛋白的微小 RNA 预测：序列特异性治疗开发的窗口

潘卡杰·科帕德和谢尔扎·辛格

动机：由于流感抗原蛋白的高度可变性，传统的流感药物可能会导致药物失效。序列特异性疗法的计算机预测耗时较少且成本低廉。大多数 miRNA 靶标预测平台在预测的特异性和灵敏度方面有所不同。在这里，我们提出了一种生物信息学方法来预测针对禽流感 H5N1 病毒非结构蛋白 1 和猪流感 H1N1 病毒第 8 段的微 RNA。

结果： hsa-miR-138、hsa-miR-525-5p 和 hsa-miR-124 被筛选为针对 H5N1 病毒 NS1 蛋白的潜在序列特异性治疗药物。对不同 H1N1 片段 8 基因组的类似研究预测了可用作抗流感药物的 miRNA。预测的 micro RNA 还在宿主细胞的调节过程、应激相关通路（包括 MAPK 通路、mTOR 通路）中发挥作用，并被发现参与与癌症相关的通路。