Gomase VS、Chitlange NR、Sherkhane AS、Changbhale SS 和 Kale KV
班氏丝虫是一种线状线虫,是淋巴丝虫病的病原虫之一,感染该病的
淋巴和生殖器官会暂时或永久丧失功能;迄今为止,尚未发现治疗淋巴丝虫病的有效药物或疫苗。在本次分析中,我们预测了班氏丝虫肌钙蛋白的抗原肽,用于设计针对淋巴丝虫病的合成肽疫苗,因为单个蛋白质亚基可以在大量群体中产生免疫反应。分析表明,班氏丝虫肌钙蛋白的预测表位是预防淋巴丝虫病的重要决定因素。在本测定中,我们分析了具有 136 个氨基酸的班氏丝虫肌钙蛋白的结合亲和力,显示出 128 个非聚体。在本研究中,我们通过两种不同的方法预测了 CTL 表位,即 SVM(支持向量机)和 ANN(人工神经网络),基于 SVM 的预测显示 16 个有效表位在截止值 0.36 时具有最佳得分 1.129,而基于 ANN 的预测显示 31 个有效表位在截止值 0.51 时具有最佳得分 1.000。我们还预测了基于级联 SVM 的 TAP 结合物和四个潜在抗原表位,即 31-LRKLIRK-37、49-DEFCALVYTVANT-61、87-SRPTLKALLKE-97、108-EAAVDE-113(最佳倾向 1.223),这些表位是根据最高局部亲水性预测的;除此之外,我们还通过实验预测了两个最长的潜在表位的三级结构,这些表位可以帮助我们了解
班氏丝虫肌钙蛋白的序列-结构-功能关系,以便设计合成肽疫苗。因此,一小段肌钙蛋白就可以产生针对班氏丝虫活性的免疫反应。这种方法可以用于设计亚单位和合成肽疫苗