植物病理学与微生物学杂志

抽象的

使用实时 PCR 快速检测和定量土壤和植物样品中的镰刀菌

Sukumar Mesapogu、Bandamaravuri Kishore Babu、Achala Bakshi、Somasani S. Reddy、Sangeeta Saxena、Alok K. Srivastava 和 Dilip K. Arora

开发了基于实时 PCR 的检测方法，用于检测引起木豆维管萎蔫的镰刀菌。以镰刀菌的组蛋白 3 基因为目标，设计了物种特异性引物和探针。进行了一项比较研究，以开发一种可靠且可重复的程序，用于检测和量化来自不同样本的镰刀菌。通过斑点印迹杂交、标准和实时 PCR 检测评估寡核苷酸的灵敏度和特异性。探针 HFUSP 对从镰刀菌纯培养物中获得的 DNA 显示出与环境 DNA 样本相比的高度灵敏度。qPCR 检测特异性地将镰刀菌与镰刀菌的近亲物种、其他测试微生物和环境样本区分开来。84.17 处的单一熔解曲线和 200 bp 的单态带表明 PCR 检测的特异性和真实性。因此，实时 PCR 检测可作为一种快速有效的方法，从复杂环境中检测出微量的 F. udum。因此，本研究中展示的实时 PCR 检测可成功用于 F. udum 的检测和监测，以进行木豆维管萎蔫病的早期感染和疾病流行病学研究。