张茜、丁南、熊茜、郑家文、李泽霞、李亚娟、李全真、方向东、张兆军
目的: KLF3(Krüppel样因子3)参与多种细胞谱系的分化和发育。然而,KLF3在K562白血病细胞造血中的调控作用仍然很大程度上未知。
方法:从NCBI的GEO数据集下载代表急性髓系白血病(AML)和急性淋巴细胞白血病(ALL)疾病异质性的公共基因表达数据库。建立KLF3缺陷的K562稳定细胞并分析微阵列数据集。使用基因本体论(GO)分析来识别KLF3缺陷的K562细胞中受影响的造血相关基因。使用Ingenuity Pathways Analysis(IPA)来识别受影响的造血相关功能、相互作用网络、通路和涉及差异表达基因(DEG)的上游调节因子。用血红素和PMA分别将KLF3缺陷的K562细胞诱导向红细胞和巨核细胞分化,并进行表型分析。我们还利用qPCR技术分析了K562细胞向红细胞和巨核细胞分化过程中KLF3的表达情况。
结果:我们发现KLF3在患者的原发性急性白血病母细胞中异常低表达,并与白血病细胞未成熟的髓系或淋巴系表型的积累有关。生物信息学分析表明KLF3与K562白血病细胞的造血相关功能密切相关,并可能调节不同血细胞谱系的造血,包括红细胞和巨核细胞。KLF3可能与血液病的病理有关。最后,功能分析表明KLF3的缺失加速了K562白血病细胞向红系和巨核细胞分化,是K562白血病细胞早期造血所必需的,并提出了KLF3调控K562细胞造血的潜在机制。
结论:我们的研究结果首次揭示了KLF3调控K562白血病细胞向红系和巨核细胞分化,KLF3的缺失是K562白血病细胞向红系和巨核细胞分化的早期所必需的。