植物病理学与微生物学杂志

抽象的

黄体病毒与大麦黄矮病毒的关系

霍达·马·瓦齐里*、哈拉·阿明、KE·萨克尔、AM·索利曼

对从埃及小麦植株中分离的大麦黄矮病毒 (BYDV-PAV) 进行了鉴定。针对大麦黄矮病毒 (BYDV-PAV) 分离物的两个编码区，即位于开放阅读框 (ORF1) 中的聚合酶基因 (P1) 和位于开放阅读框 (ORF3) 中的外壳蛋白基因 (CP)。根据 Genbank 中的 BYDV-PAV 分离物设计了两组特异性引物。克隆并测序了 BYDV-PAV 埃及分离物的 ORF1 和 ORF3 的 DNA 片段。该序列包含编​​码病毒聚合酶基因 (P1) 的全长 ORF1。它的长度为 910 个结，编码一条预测的 303 个氨基酸的多肽链，M(r) 为 34.67。另一方面，病毒外壳蛋白ORF3基因序列显示其长度为603 bp，编码一个预测的200个氨基酸的蛋白质，分子量为21.96 KDa。然而，基于埃及分离株Egy-Wz与NCBI GenBank中现有分离株的多重序列比对构建的系统发育同源树显示，聚合酶基因（P1）在氨基酸和核苷酸水平上与05GG2、PAV 014和PAV014、PAV-Aus分离株的序列同源性分别为76.5%-99%和71.6%-93.2%。另一方面，外壳蛋白基因（CP）在氨基酸和核苷酸水平上与两个分离株06KM14和05GG2分别有85.1%-99.5%和89.7%-99.2%的序列相似性。