植物病理学与微生物学杂志

抽象的

Rep-PCR 基因组指纹揭示了菜豆（ Phaseolus vulgaris L.）病原菌灰假尾孢埃塞俄比亚分离株的遗传多样性和种群结构

Yayis Rezene、Kassahun Tesfaye、Mukankusi Clare、Allan Male 和 Paul Gepts

角斑病（Pseudocercospora griseola）是影响埃塞俄比亚大部分地区菜豆生产的最具破坏性的疾病之一。因此，使用具有持久抗性的菜豆品种是最有效和经济的控制措施。了解病原体种群的遗传变异和种群结构对于成功的菜豆改良计划至关重要。本研究的目的是确定从埃塞俄比亚不同菜豆种植区的实地调查收集的P. griseola分离株之间存在的基因组多样性。该研究使用重复性基因外回文元件-聚合酶链反应方案来指纹识别 DNA 序列多样性。为了研究遗传多样性，我们分析了来自 79 个P. griseola病原体单孢分离株的分子数据。因此，分子变异分析 (AMOVA) 和聚类分析揭示了P. griseola分离株内部和之间存在高度遗传多样性。 ERIC PCR 产生了 21 种不同的簇模式，而 REP-PCR 和 BOX PCR 分别产生了 11 种和 5 种不同的簇模式。这是因为一些具有相同 BOX 模式的分离物可以通过 ERIC 和 REP 指纹模式来区分。ERIC-、BOX- 和 REP-PCR 组合指纹模式在 79 个单孢P. griseola分离物中区分出 25 种不同的模式，这些分离物是在 77% 的遗传相似性矩阵截止点产生的。这些区分的簇揭示了从埃塞俄比亚不同的普通豆种植区收集的P. griseola分离物内部和之间存在遗传多样性。