基因科技

抽象的

sdRNA：具有 DNA 种子的 siRNA，可实现高效且靶基因特异性的 RNA 干扰

衣亭久美子

RNA 干扰 (RNAi) 是一种小干扰 RNA (siRNA) 诱导序列特异性转录后基因沉默的过程，被公认为不仅在功能基因组学中而且在治疗应用方面都是一种强大的工具。为了实现准确的靶基因功能和成功的治疗应用，必须选择一种高效且靶基因特异性的

siRNA 具有最小的脱靶效应。我们发现，诱导非目标基因脱靶效应的能力与种子区域（siRNA 引导链 5' 端 2-8 位）和靶 mRNA 之间形成的双链的热力学稳定性密切相关。与此特性一致，我们发现，由于 DNA-RNA 双链在种子-靶碱基配对中的稳定性较低，在引导链 5' 端近端八个核苷酸中含有脱氧核糖核苷酸，而在过客链中含有互补核苷酸的 DNA-RNA 嵌合 siRNA (chiRNA) 几乎不产生脱靶效应。然而，DNA 替换也使主要靶基因的相应 RNAi 活性平均降低十分之一。本文，我们报告称，在种子区域 (sdRNA) 中仅含有七个脱氧核糖核苷酸的 siRNA 可能表现出有效的靶特异性，但脱靶效应会降低 RNAi 活性。