遗传遗传学：当前研究

抽象的

籼稻DREB基因分子特性研究

Jadhao KR、Samal KC、Pradhan SK 和 Rout GR

通过转录组和转基因方法，已经鉴定出许多与谷物对干旱的适应性反应有关的潜在候选基因 (CG)。赋予抗旱性的这些基因之一是 DREB 基因家族。探索 DREB 基因家族内的遗传/等位基因变异是更好地了解抗逆性的重要先决条件。本研究旨在研究不同水稻品种中 DREB 基因内核苷酸序列的等位基因变异，以进行作物改良计划。十个旱地和水地水稻品种用于分子表征和等位基因挖掘。结果表明，在所有测试种质中均发现了 DREB 基因，并已提交给 NCBI GenBank（登录号 KF 545561 至 KF 545569）。生物信息学分析表明，与 59 个氨基酸的 AP2 DNA 结合域具有 100% 的同一性，该结构域显示出保守的三个片层，其中第 14 个缬氨酸和第 19 个谷氨酸保守残基。推测的DREB蛋白的AP2结构域富含丙氨酸（17.6%）和精氨酸（15.7%）氨基酸，预测的分子量为5.89 kDa，等电点（pI）为10.38。通过DNA多态性分析验证了DREB基因核苷酸序列，其中鉴定出196个不变（单态）和8个可变（多态）即分离位点，包括9个突变和5个单倍型。单倍型（基因）多样性为0.756；方差和标准差多样性分别为0.01678和0.130。结果表明，品种‘Khandagiri’与水稻所有种质DREB基因的相似性为97.5%，与数据库中存在的AK121956种质的进化分歧为0.036%。这可能增强了DREB基因作为转录因子的能力，从而提高了品种在干旱期间的适应能力和耐受能力。