王秀英、王洪宇、Y 振亚、W 国祯、夏 X
本研究旨在描述和比较相同饮食但不同产奶量的六头中国荷斯坦奶牛(CHC1、CHC2、CHC3、CHC4、CHC5、CHC6)的肠道微生物。采用高通量测序分析揭示和比较粪便中的细菌群落。结果显示,六个样本中共有13个门,最优势的门是厚壁菌门(约占71%的OTU),其中18%的OTU属于瘤胃球菌科。拟杆菌门是次优势门,占总OTU的17.5%。虽然发现的大多数细菌属未分类,但Solibacillus和Acinetbacter分别是第一和第二优势属。其中,相同饲粮条件下中国荷斯坦奶牛肠道微生物多样性和丰度差异均不显著,提示产奶量与肠道微生物的关系比较稳定。对与产奶量相关的因素进行Spearman秩和检验(p<0.05),结果表明,产奶量与中国荷斯坦奶牛年龄(P=0.029)和体长(P=0.021)显著相关。经LEfSe分析(LDA阈值为2),筛选出不同产奶期中国荷斯坦奶牛肠道中存在显著差异的微生物,其中,毛螺菌科、柔膜菌科、软膜菌科、软膜菌科明显富集HMY,而只有纤维杆菌科明显富集LMY。说明微生物在产奶中国荷斯坦奶牛产奶中发挥着重要作用。