临床与医学生物化学

抽象的

四硫桥（TTSB）的形成：HIV-1 gp120 分子结构和动力学中一种特殊的中间结构

哈里·F·克雷夫科尔

Gp120 是执行 HIV 病毒进入 CD4+ 细胞的分子之一，具有许多变构二硫键。在本研究中，我们探索了这些潜在二硫键在 3-D 结构中的动态（基于晶体学）和 UNSW DBA 对各种 gp120 晶体的分析。数据显示存在四硫键 (TTSB)，它与二硫键一起使两个垂直的 beta 片层（即 V3 和 V4）在 gp120 的架构中保持近似，同时允许变构键之间安全地传递能量。对多个 gp120 晶体的分析表明，TTSB 的存在更像是一种中间体，而不是恒定的标志，这意味着它的功能比结构属性更复杂。这种 TTSB 在各种 gp120 晶体、各种 HIV-1 菌株和分支中均有发现，各种渲染软件都证明了这一点，一些 TTSB 还通过 UNSW 二硫键分析 (DBA) 引擎进行检测、报告和表征。该四硫键将变构键 Cys296-Cys331 连接到 Cys385-Cys418，有时以 CYS331:SG-CYS385:SG 的形式出现，有时以 CYS331:SG-CYS418:SG 的形式出现。此外，在晶体 3TIH、4LSR 和 4R4N 中，我们还观察到了 TTSB 的中间状态，其中它呈现三角形结构，其中硫原子 CYS331:SG 同时与 CYS385:SG 和 CYS418:SG 结合，这代表了 gp120 分子功能动力学中的重要中间体。这种非凡结构（TTSB）的存在确实为 gp120 分子的多功能设计和力学以及一些复杂的脆性提供了一些有趣的见解，揭示了抗病毒治疗的新目标。