植物病理学与微生物学杂志

抽象的

5´ â†' 3´ 外切核糖核酸酶 2 是开发控制巴拿马病的杀菌剂的潜在靶标

Maldonado Bonilla LD 和 Calderón-Oropeza MA

目前，尖镰孢菌热带 4 号种的爆发正威胁着全球香蕉的生产。由于商业香蕉植株的克隆特性，选择抗性品种似乎不可行；因此，必须开发替代的农作物保护方法。5' → 3' 外切核糖核酸酶 XRN2/RAT1 参与 5' → 3' RNA 降解。对 XRN2 和条件突变体的真菌研究表明了这种酶的关键作用，这表明应将 XRN2 视为寻找可用作控制巴拿马病的杀菌剂的新型抑制剂的目标。我们对热带 4 号种 XRN2 (FocTR4XRN2) 的计算机分析揭示了 5' → 3' 外切核糖核酸酶的特征，例如识别 5'-单磷酸化 RNA 并催化单核苷酸加工裂解的催化域。具有底物吸收潜力的界定空腔似乎易于与可能抑制其活性的小分子相互作用。FocTR4XRN2 中的催化域包含 CCHC 基序，该基序在丝状真菌的直系同源蛋白中是保守的，但在酵母中却不存在。与焦磷酸水解酶 RAI1 相互作用所涉及的残基也是保守的。分子对接揭示了 FocTR4XRN2 与天然抑制剂腺苷 3', 5' 双磷酸的潜在相互作用，并表明这种方法可用于筛选可能有助于抑制巴拿马病病原体进展的新型酶抑制剂。