基因组学和蛋白质组学数据挖掘杂志

抽象的

桑树线粒体全基因组序列变异及系统发育分析

郭亮亮、史一苏、吴萌萌、Michael Ackah、林强、赵卫国*

背景：桑树是一种经济作物，能适应各种环境条件。桑树（叶）可用于喂养蚕，也可用于景观美化，具有很高的开发前景和科研价值。线粒体是植物的动力源，可产生进行生命过程所需的能量。

目的：植物线粒体 (mt) 基因组是植物生命过程所需的能量源。然而，桑树植物的线粒体 (mt) 基因组仍未被探索。本研究调查了桑属植物( M. atropurpurea和M. multicaulis ) 的线粒体基因组，并将其与其他植物物种进行了比较。

方法：利用 Oxford Nanopore Prometh ION 对桑属植物（M. atropurpurea和M. multicaulis ）的线粒体基因组进行测序，并对数据进行整理和分析，然后与其他植物线粒体基因组进行比较。进行系统发育分析，研究所研究的桑树植物的进化地位

结果：M. multicaulis环状线粒体基因组长度为361,546 bp，包含54个基因，包括31个蛋白编码基因，20个tRNA基因和3个rRNA基因，组成为A（27.38%）、T（27.20%）、C（22.63%）和G（22.79%）。M. atropurpurea环状线粒体基因组长度为395,412 bp，由C+G（45.50%）组成，包含57个功能基因，包括2个rRNA基因，22个tRNA基因和32个PCG。M. multicaulis和M. atropurpurea线粒体基因组中存在序列重复、RNA编辑基因和从cp向mt的迁移。

基于桑属植物和其他 28 个物种的完整线粒体基因组进行的系统发育分析反映了准确的进化和分类地位。

结论：我们发现桑属植物mt基因组为环状，其中M. multicaulis基因组长度为361,546 bp，包含54个基因，包括31个蛋白质编码基因、20个tRNA基因和3个rRNA基因。此外，M. atropurpurea基因组长度为395,412 bp。此外，基因组中注释了总共57个基因，包括32个蛋白质编码基因、22个tRNA和3个rRNA。结果将提供对桑属mt基因组的全面了解，并可能有助于未来桑树品种的研究和育种。