抽象的

冻融循环对抗原或核酸检测中 SARS-CoV-2 病毒培养液和临床残留样本完整性的影响

Hajirah Noor Hussain、Hali Weeks、Derek Zhou、Divya Joseph、Brooke Lam、徐海东、张楚实、Keqin Gregg、周文丽*

超低温保存一直是包括SARS-CoV-2病毒在内的许多类型临床标本长期储存的黄金标准。冷冻标本可以轻松运输和随后的检测。此外,去除身份信息的冷冻残留样本是许多临床前或临床研究的资源。因此,了解冷冻样本检测时冻融循环 (FTC) 是否会对 SARS-CoV-2 检测性能产生不利影响至关重要。一些早期研究表明,FTC 增加了逆转录实时 PCR (RT-PCR 或 RT-qPCR) 的循环阈值 (Ct),表明 FTC 后 SARS-CoV-2 核酸可能会降解,而其他研究表明 FTC 后 SARS-CoV-2 核酸并未发生任何显著变化。此外,关于 FTC 对 SARS-CoV-2 抗原测试性能的影响的报道也很少。

在本研究中,我们对同一样本进行了配对核酸和快速抗原检测,以研究并直接比较 FTC 如何影响两种检测的性能。研究对象包括灭活病毒培养液样本和临床残留样本。我们的结果表明,FTC 对快速 SARS-CoV-2 抗原检测的性能几乎没有负面影响,并且在整个 FTC 期间检测结果基本保持一致,而 RT-PCR 的 Ct 值随着 FTC 数量的增加而增加。此外,我们的数据还表明,在核酸检测的 FTC 期间,SARS-CoV-2 在病毒运输培养基 (VTM) 中的保存效果比在磷酸盐缓冲盐水 (PBS) 中更好。

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