基因组学和蛋白质组学数据挖掘杂志

抽象的

终末期肾病中 IFN-γ、SOCS1 和 SOCS3 启动子区甲基化情况

Maivel Ghattas、Fatma El-shaarawy、Noha Mesbah 和 Dina Abo-Elmatty

终末期肾病 (ESRD) 是一种慢性炎症状态。DNA 甲基化是一种主要的表观遗传修饰，有可能沉默基因表达。IFN-γ 和细胞因子信号抑制因子 (SOCS) 是炎症的重要调节剂。本研究旨在确定从 ESRD 患者和对照组外周血中分离的 DNA 中 IFN-γ、SOCS1 和 SOCS3 启动子区域的甲基化状态，以便将这种甲基化状态与 ESRD 的临床特征联系起来。本研究纳入了 96 名 ESRD 患者和 96 名种族、年龄和性别匹配的健康对照者。使用甲基化特异性聚合酶链反应 (MSP) 评估所研究基因的启动子甲基化。我们的大多数样本对 IFN-γ 启动子甲基化呈阳性。仅在 ESRD 组 (7.3%) 中观察到完全未甲基化，并且各组之间存在统计学差异 (P=0.02)。 IFN-γ 未甲基化与估计肾小球滤过率 (eGFR) 下降以及血清肌酐和总胆固醇水平升高相关。对于 SOCS1 启动子甲基化，仅在 ESRD 患者中观察到部分和完全甲基化（分别为 5.2% 和 2.1%）；然而在对照组中未检测到甲基化（P=0.014）。患者组和对照组均未检测到 SOCS3 启动子甲基化。总之，IFN-γ 和 SOCS1 启动子区域的甲基化谱在 ESRD 的发病机制中起着重要作用。本研究强调了表观遗传学在疾病进展中的作用。