生物分子研究与治疗杂志

抽象的

人类血浆蛋白质组的宽度与癌细胞系和细菌的比较

安德烈·V·利西察 (Andrey V Lisitsa)、叶卡捷琳娜·V·波维伦纳亚 (Ekaterina V Poverennaya)、埃琳娜·波诺马连科 (Elena A Ponomarenko) 和亚历山大·一世·阿尔查科夫 (Alexander I Archakov)

全基因组测序揭示了特定生物体中蛋白质编码基因的数量，这可以看作是分子复杂性的初步近似值。由于转录后和翻译后修饰，例如 RNA 剪接、多态性、共价修饰和降解，不同蛋白质种类的总数（蛋白质组）可能比蛋白质编码基因的数量大得多。2-D 凝胶电泳可用于估计人类蛋白质组的宽度。在不同蛋白质上样条件下用不同染色剂（染料）获得的斑点数量可以粗略地了解样品中不同蛋白质的数量。已经研究了人类血浆和细胞系以及细菌细胞的数据，以确定斑点数量对染料灵敏度的依赖性。假设每个斑点代表不同的蛋白质种类，斑点与灵敏度的依赖性被用作蛋白质组宽度的估计值。理论上，1升血浆中含有175万种蛋白质，每个HepG2细胞中有18,000种蛋白质，每个细菌中有6,700种蛋白质。