植物病理学与微生物学杂志

抽象的

使用翻译延伸因子基因专门检测和诊断埃塞俄比亚、东非和中非咖啡枯萎病的病原体——木霉镰刀菌。

Olal S、Olango N、Kiggundu A、Ochwo S、Adriko J、Nanteza A、Matovu E、Lubega GW、Kagezi G、Hakiza GJ、Wagoire WW、Rutherford MA 和 Opiyo SO

本研究首次报告了基于 DNA 的聚合酶链式反应 (PCR) 在 F usarium xylarioides (无性型：G ibberrela xylarioides) 特异性检测和诊断中的应用。Fusarium xylarioides 是咖啡枯萎病 (气管菌病) 的病原体，该病是乌干达罗布斯塔咖啡生产最重要的经济制约因素。该病原体有两个品系，一个对罗布斯塔咖啡有致病性，另一个对阿拉比卡咖啡有致病性，反之则不然。其实验室诊断主要基于显微镜检查，这种方法速度慢、鉴别力差、需要很高的专业知识、仅适用于有症状的宿主植物，而且无法从土壤中检测出病原体。从受感染的罗布斯塔咖啡植物中分离的 F. xylarioides 的翻译延伸因子-1α (TEF-1α) 基因通过镰刀菌属特异性引物进行扩增，然后对 PCR 产物进行测序。然后使用序列数据设计特异性引物。发现引物-BLAST产物仅与F. xylarioides序列匹配，该序列包含75%对罗布斯塔咖啡致病的菌株和25%对阿拉比卡咖啡致病的菌株。PCR体外测试表明，该引物仅对F. xylarioides具有特异性，扩增284bp产物，并且能够将F. xylarioides与所有密切相关的镰刀菌种和其他测试的植物病原体区分开来。更重要的是，它能够扩增来自乌干达不同地区的所有F. xylarioides分离株的DNA，扩增的DNA浓度低至0.78 ng/µL。