基因组学和蛋白质组学数据挖掘杂志

抽象的

RNA-Seq 数据的可视化挖掘方法：数据结构、离散度估计和显著性检验

尹腾飞、马布布尔·马宗德尔、尼拉德里·罗伊·乔杜里、黛安·库克、兰迪·舒梅克和米歇尔·格雷厄姆

在对大豆 RNA-Seq 数据的分析中，使用一个软件包进行初始显著性检验产生的基因列表与使用另一个软件包产生的基因列表大不相同。这是怎么发生的？本文展示了如何调查结果之间的差异，并对其进行了解释。这种矛盾在高通量分析中更常见。为了探索模型拟合和假设检验，我们实现了一个交互式图形，允许探索离散估计对方差和差异表达检验的总体估计的影响。此外，我们提出了一种新程序来测试生物数据中是否存在任何结构。