基因组学和蛋白质组学数据挖掘杂志

抽象的

全外显子组测序揭示与家族性乳腺癌相对风险相关的罕见高外显率和低外显率变异组合

本·雷卡亚·玛丽姆、哈姆迪·约瑟、艾尔·本纳·胡达、梅杰里·内斯林、杰丹·奥尔法、阿亚里·吉亨、本·纳斯尔·索尼娅、达拉利·哈姆扎、梅萨乌德·奥尔法、梅德布·莱姆、米格里·纳贾、布杰马·马鲁阿、布巴克·穆罕默德·萨米尔、哈达维·阿卜杜拉泽克、Mrad Ridha、布森哈穆达,阿卜杜勒哈克·索尼娅、拉比迪·苏玛亚1

目的：我们旨在同时调查和识别无关乳腺癌（BC）病例中所有罕见致病变异和常见变异。

方法：通过 Sanger 测序，排除了 42 名具有高家族风险且至少有 3 名相关个体患癌症的女性中突尼斯先前发现的所有 BRCA 基因常见突变。选择了两个具有不同家族史的无关联病例进行全外显子组测序。确认选定的高风险变异并进行分离分析。

结果：我们在三例乳腺癌病例中发现了 BRCA2 p.Val1283Lysfs 中致病的移码功能丧失变异，在两例乳腺癌病例中发现了 OGG1 中致病的罕见变异 p.Arg46Gln，该变异与 BRCA2 中罕见的无义变异 p.K3326X 共分离。这些变异从未在突尼斯或北非被描述过。

结论：患者 F1.1 的家族史和发病年龄较小与 BRCA2 基因中存在高渗透性变异 (p.Val1283Lysfs) 有关。然而，患者 F2.2 的发病年龄较晚和表型较不严重，这是因为 BRCA2 中存在低渗透性变异 Lys3326X，该变异仅在 BC 病例中与 OGG1 基因中的致病性变异 p.Arg46Gln 共分离。